MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium sp. MCS chromosome

Total Repeats: 146841

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008146	CCGACC	2	12	27	38	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	108796982
2	NC_008146	CGT	2	6	64	69	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108796982
3	NC_008146	GCC	2	6	92	97	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108796982
4	NC_008146	ACGGTG	2	12	111	122	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	108796982
5	NC_008146	GCA	2	6	142	147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108796982
6	NC_008146	CTG	2	6	200	205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108796982
7	NC_008146	ATC	2	6	260	265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108796982
8	NC_008146	GCC	2	6	276	281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108796982
9	NC_008146	GAC	3	9	335	343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108796982
10	NC_008146	CCG	3	9	344	352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108796982
11	NC_008146	CGA	2	6	373	378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108796982
12	NC_008146	CGA	2	6	382	387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108796982
13	NC_008146	GCC	2	6	438	443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108796982
14	NC_008146	GCC	2	6	458	463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108796982
15	NC_008146	CCCGG	2	10	571	580	0 %	0 %	40 %	60 %	108796982
16	NC_008146	GTT	2	6	592	597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108796982
17	NC_008146	CTG	2	6	632	637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108796982
18	NC_008146	TCA	2	6	720	725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108796982
19	NC_008146	CGA	2	6	736	741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108796982
20	NC_008146	CGT	2	6	750	755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108796982
21	NC_008146	TGC	2	6	783	788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108796982
22	NC_008146	CGA	2	6	793	798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108796982
23	NC_008146	AAGG	2	8	818	825	50 %	0 %	50 %	0 %	108796982
24	NC_008146	TTC	2	6	839	844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108796982
25	NC_008146	TCC	2	6	890	895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108796982
26	NC_008146	GCC	2	6	901	906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108796982
27	NC_008146	GGA	2	6	925	930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108796982
28	NC_008146	GCC	2	6	976	981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108796982
29	NC_008146	AAG	2	6	1013	1018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108796982
30	NC_008146	CGA	2	6	1045	1050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108796982
31	NC_008146	CAG	2	6	1069	1074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108796982
32	NC_008146	CAA	2	6	1138	1143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108796982
33	NC_008146	TCGC	2	8	1160	1167	0 %	25 %	25 %	50 %	108796982
34	NC_008146	TGC	2	6	1176	1181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108796982
35	NC_008146	ATCTC	2	10	1185	1194	20 %	40 %	0 %	40 %	108796982
36	NC_008146	GCC	2	6	1235	1240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108796982
37	NC_008146	CCG	2	6	1242	1247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108796982
38	NC_008146	GAA	2	6	1414	1419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108796982
39	NC_008146	CGC	2	6	1442	1447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108796982
40	NC_008146	CAC	2	6	1474	1479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108796982
41	NC_008146	GC	3	6	1492	1497	0 %	0 %	50 %	50 %	108796982
42	NC_008146	GTG	2	6	2075	2080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108796983
43	NC_008146	CGA	2	6	2082	2087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108796983
44	NC_008146	CGG	2	6	2088	2093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108796983
45	NC_008146	TGC	2	6	2202	2207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108796983
46	NC_008146	CGA	3	9	2215	2223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108796983
47	NC_008146	TGT	2	6	2322	2327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108796983
48	NC_008146	GCC	2	6	2528	2533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108796983
49	NC_008146	CGA	2	6	2539	2544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108796983
50	NC_008146	GGC	2	6	2602	2607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108796983
51	NC_008146	ACCG	2	8	2609	2616	25 %	0 %	25 %	50 %	108796983
52	NC_008146	CGA	2	6	2649	2654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108796983
53	NC_008146	GGC	2	6	2707	2712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108796983
54	NC_008146	CTG	2	6	2783	2788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108796983
55	NC_008146	GCA	2	6	2811	2816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108796983
56	NC_008146	CTG	2	6	2858	2863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108796983
57	NC_008146	CGA	2	6	2886	2891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108796983
58	NC_008146	TGG	2	6	2934	2939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108796983
59	NC_008146	CGA	2	6	2974	2979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108796983
60	NC_008146	CCG	2	6	2994	2999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108796983
61	NC_008146	CGA	2	6	3004	3009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108796983
62	NC_008146	GAG	2	6	3023	3028	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108796983
63	NC_008146	ACG	2	6	3137	3142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108796983
64	NC_008146	TCC	2	6	3159	3164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108796983
65	NC_008146	CGG	2	6	3168	3173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108796983
66	NC_008146	CGA	2	6	3175	3180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108796983
67	NC_008146	CGG	2	6	3187	3192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108796983
68	NC_008146	GACCG	2	10	3264	3273	20 %	0 %	40 %	40 %	108796983
69	NC_008146	TGG	2	6	3308	3313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108796984
70	NC_008146	GTC	2	6	3370	3375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108796984
71	NC_008146	TCGC	2	8	3412	3419	0 %	25 %	25 %	50 %	108796984
72	NC_008146	GTG	2	6	3451	3456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108796984
73	NC_008146	GTCCG	2	10	3471	3480	0 %	20 %	40 %	40 %	108796984
74	NC_008146	CACG	2	8	3483	3490	25 %	0 %	25 %	50 %	108796984
75	NC_008146	TCGC	2	8	3502	3509	0 %	25 %	25 %	50 %	108796984
76	NC_008146	CGG	2	6	3543	3548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108796984
77	NC_008146	CGCA	2	8	3575	3582	25 %	0 %	25 %	50 %	108796984
78	NC_008146	GT	3	6	3623	3628	0 %	50 %	50 %	0 %	108796984
79	NC_008146	CGG	2	6	3630	3635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108796984
80	NC_008146	CGG	2	6	3672	3677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108796984
81	NC_008146	CGA	2	6	3678	3683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108796984
82	NC_008146	C	6	6	3726	3731	0 %	0 %	0 %	100 %	108796984
83	NC_008146	TGA	2	6	3821	3826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108796984
84	NC_008146	GTT	2	6	3849	3854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108796984
85	NC_008146	GCC	2	6	3856	3861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108796984
86	NC_008146	GAG	2	6	3862	3867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108796984
87	NC_008146	GGT	2	6	3915	3920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108796984
88	NC_008146	GCA	2	6	3933	3938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108796984
89	NC_008146	GCT	2	6	3939	3944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108796984
90	NC_008146	GGA	2	6	3960	3965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108796984
91	NC_008146	GAG	2	6	4027	4032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108796984
92	NC_008146	GTGCCG	2	12	4048	4059	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	108796984
93	NC_008146	CG	3	6	4080	4085	0 %	0 %	50 %	50 %	108796984
94	NC_008146	AGG	2	6	4100	4105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108796984
95	NC_008146	CCA	2	6	4112	4117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108796984
96	NC_008146	CGG	2	6	4149	4154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108796984
97	NC_008146	GTT	2	6	4240	4245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108796985
98	NC_008146	GC	4	8	4283	4290	0 %	0 %	50 %	50 %	108796985
99	NC_008146	TCG	2	6	4323	4328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108796985
100	NC_008146	CG	4	8	4437	4444	0 %	0 %	50 %	50 %	108796985
101	NC_008146	GTG	2	6	4445	4450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108796985
102	NC_008146	GTG	2	6	4460	4465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108796985
103	NC_008146	CAC	2	6	4501	4506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108796985
104	NC_008146	TGC	2	6	4572	4577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108796985
105	NC_008146	GCG	2	6	4617	4622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108796985
106	NC_008146	CGC	3	9	4634	4642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108796985
107	NC_008146	CGA	2	6	4648	4653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108796985
108	NC_008146	CCA	2	6	4659	4664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108796985
109	NC_008146	CTG	2	6	4730	4735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108796985
110	NC_008146	CGC	2	6	4741	4746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108796985
111	NC_008146	CGC	2	6	4810	4815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108796985
112	NC_008146	GTT	2	6	4825	4830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108796985
113	NC_008146	CG	4	8	4837	4844	0 %	0 %	50 %	50 %	108796985
114	NC_008146	CAC	2	6	4856	4861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108796985
115	NC_008146	CGGC	2	8	4910	4917	0 %	0 %	50 %	50 %	108796985
116	NC_008146	TAC	2	6	4970	4975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108796985
117	NC_008146	GCC	2	6	4979	4984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108796985
118	NC_008146	CCG	2	6	5002	5007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108796985
119	NC_008146	GAC	2	6	5057	5062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108796985
120	NC_008146	GCCA	2	8	5102	5109	25 %	0 %	25 %	50 %	108796985
121	NC_008146	GCC	2	6	5147	5152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108796985
122	NC_008146	TCC	2	6	5187	5192	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108796985
123	NC_008146	CGC	2	6	5221	5226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108796985
124	NC_008146	CGG	2	6	5228	5233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108796985
125	NC_008146	CGG	2	6	5283	5288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108796985
126	NC_008146	CCG	2	6	5304	5309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108796985
127	NC_008146	GCG	2	6	5320	5325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108796985
128	NC_008146	GAC	3	9	5345	5353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108796985
129	NC_008146	TGG	2	6	5370	5375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108796985
130	NC_008146	CGA	3	9	5385	5393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108796986
131	NC_008146	GGCGAC	2	12	5401	5412	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	108796986
132	NC_008146	GCG	2	6	5463	5468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108796986
133	NC_008146	GAA	2	6	5476	5481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108796986
134	NC_008146	GCG	2	6	5491	5496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108796986
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136	NC_008146	GCG	2	6	5620	5625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108796986
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140	NC_008146	CGT	2	6	5891	5896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108796986
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142	NC_008146	TACG	2	8	5940	5947	25 %	25 %	25 %	25 %	108796986
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261	NC_008146	CTA	2	6	10588	10593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108796988
262	NC_008146	GCG	2	6	10621	10626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108796988
263	NC_008146	CGA	2	6	10702	10707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108796988
264	NC_008146	CG	3	6	10747	10752	0 %	0 %	50 %	50 %	108796988
265	NC_008146	GGCC	2	8	10753	10760	0 %	0 %	50 %	50 %	108796988
266	NC_008146	GCT	2	6	10768	10773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108796988
267	NC_008146	CGA	2	6	10780	10785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108796988
268	NC_008146	CCAGGC	2	12	10789	10800	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	108796988
269	NC_008146	GCG	2	6	10819	10824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108796988
270	NC_008146	GCC	2	6	10829	10834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108796988
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274	NC_008146	CGA	2	6	10972	10977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108796988
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276	NC_008146	CGA	2	6	11017	11022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108796988
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280	NC_008146	GAC	2	6	11153	11158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108796988
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283	NC_008146	TTC	2	6	11204	11209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108796988
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291	NC_008146	GAC	2	6	11504	11509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108796988
292	NC_008146	CTG	2	6	11513	11518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108796988
293	NC_008146	CGA	2	6	11557	11562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108796988
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295	NC_008146	CGA	3	9	11620	11628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108796988
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301	NC_008146	CCG	2	6	11767	11772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108796988
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378	NC_008146	GT	3	6	15433	15438	0 %	50 %	50 %	0 %	108796994
379	NC_008146	GCC	2	6	15442	15447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108796994
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382	NC_008146	CCG	2	6	15495	15500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108796994
383	NC_008146	TGG	2	6	15518	15523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108796994
384	NC_008146	GCA	2	6	15540	15545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108796994
385	NC_008146	CCA	2	6	15600	15605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108796994
386	NC_008146	GCG	2	6	15628	15633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108796994
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